锦鲤经过不断杂交、改良和选育，现已培育出一百多个品种，日本锦鲤根据色彩、斑纹以及鳞片的分布情况，主要划分为13类。

1、红白锦鲤：体表底色为银白色，镶嵌有变幻的红色斑纹。

2、大正三色锦鲤：鱼体底色雪白，又浮现出绯红、乌黑两色斑纹。

3、写鲤：鱼体以黑色为底色，上面有三角形的或白或红或黄的斑纹。

4、昭和三色锦鲤：鱼体以黑色为底色，上有红、白花纹。

5、别光锦鲤：在白、红、黄的不同底色上，呈现黑斑纹。

6、浅黄锦鲤：背部呈深蓝色或淡蓝色，而鳞片的外缘呈白色，左或颊颚、腹部和各鳍基部呈红色。

7、衣锦鲤：是浅黄锦鲤和红白锦鲤或三色锦鲤杂交的后代。

8、黄金锦鲤：鱼体全身为金黄色。

9、光写锦鲤：写鲤与黄金鲤杂交而成的后代。

10、花纹皮光鲤：无鳞鲤形成两色以上花纹。

11、金银鳞锦鲤：通过不断杂交，鱼体全身有金色或银色鳞片，闪闪发光。

12、丹顶锦鲤：头部具有一块鲜艳圆形红斑，酷似丹顶鹤头顶上的红冠。

13、变种鲤：除以上12种外，其他品种归属此类。